Le Sezioni Territoriali operano a livello regionale per promuovere gli obiettivi della Società Chimica Italiana, mantenendo un dialogo costante con università, enti di ricerca, scuole e realtà produttive del territorio. Rappresentano un presidio fondamentale per la diffusione della cultura chimica e per il coinvolgimento della comunità scientifica locale.

Attualmente, la SCI conta 17 Sezioni attive su tutto il territorio nazionale. Ciascuna Sezione è guidata da un Presidente e da un Consiglio Direttivo, che ne coordinano le attività scientifiche, formative e divulgative in coerenza con la missione della Società.